Zenodo : la science ouverte aux avants-postes de la recherche sur le COVID-19

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Zenodo est une plateforme d'archivage reposant sur le principe de la science ouverte, qui a été conçue par le CERN dans le cadre du projet OpenAire lancé par la Commission européenne. Les scientifiques peuvent y partager des ensembles et des flux de données, des logiciels, des rapports et toute autre ressource numérique liée à la recherche. Grâce à Zenodo, tout chercheur peut accéder directement aux données brutes et dérivées, ce qui facilite et renforce la collaboration scientifique, et permet ainsi de réduire les coûts liés à la recherche, d'accélérer les cycles de recherche et, enfin, d'éviter les doublons dans la collecte des données primaires.

Pendant la pandémie de COVID-19, Zenodo met ses atouts au service de la lutte contre le virus. La plateforme bénéficie notamment de capacités de stockage accrues et de la création de communautés spécifiques:

  • La Coronavirus Disease Research Community-COVID-19, qui recueille les éléments d'information présentant un intérêt pour la recherche dans ce domaine. Elle a déjà rassemblé des milliards de données et de résultats relatifs au COVID-19 ;
  • Le National COVID Cohort Collaborative, un registre qui centralise les noms des patients ayant été testés pour le COVID-19 ou chez lesquels un diagnostic clinique de la maladie a été établi ; 
  • La communauté COVID-19 Central America, qui rassemble toutes les connaissances des pays d'Amérique centrale sur le virus SARS-CoV-2 et la maladie COVID-19.

En outre, une fonctionnalité permettant de prendre en charge des métadonnées personnalisées a été ajoutée à la plateforme. L'association Plazi a ainsi pu créer sur Zenodo la Coronavirus-Host Community. Cette communauté étudie les relations hôte-virus chez le mammifère dans le but de mieux comprendre comment le virus se transmet ensuite aux humains.

La plateforme Zenodo, fondée sur la science ouverte, revêt une grande importance en ces temps difficiles où la collaboration scientifique mondiale et transdisciplinaire est essentielle. Des scientifiques du monde entier utilisent ce système de dépôt d'archives centralisé pour partager leurs informations dans l'espoir de l'adoption rapide de mesures destinées à enrayer la pandémie.

Nous tenons à remercier l'association Plazi d'avoir accordé un don à la Fondation CERN & Société au titre du projet Zenodo.  Grâce à ce don, nous pouvons, en collaboration avec Pensoft, importer dans Zenodo des données issues de 300 000 dossiers relatifs à la biodiversité dans le cadre d'un projet financé par Arcadia Fund.