Rencontrez un utilisateur : Dr Nicolò Cogno
« L’idée était d’utiliser BioDynaMo pour reproduire les dommages causés aux tissus sains, ce qui était assez novateur. La plupart des modèles existants servent à simuler les tumeurs, leur croissance et leur réponse aux traitements. Dans ce cas précis, nous voulions voir ce qui arrivait aux tissus sains, et BioDynaMo s’est avéré extrêmement utile. »
Le modèle biologique dynamique (BioDynaMo) peut être utilisé pour étudier des systèmes complexes en simulant le comportement de milliards de cellules. Le Dr Nicolò Cogno (Harvard Medical School et Massachusetts General Hospital) a utilisé cette technologie pour mener des recherches sur le traitement du cancer.
BioDynaMo est un modèle basé sur des agents, qui permet à un chercheur de simuler des entités indépendantes pouvant interagir entre elles et avec leur environnement, et qui sont codées avec un comportement qu’elles utilisent pour réagir à une situation. L’augmentation de la puissance de calcul rend cette technologie encore plus innovante dans ce domaine.
La radiothérapie utilise les rayonnements pour tenter d’endommager l’ADN des cellules cancéreuses. Malgré les nombreux progrès réalisés dans ce domaine, ce type de traitement peut encore produire des effets secondaires désagréables, tels que la fibrose induite par les rayonnements.
Le Dr Cogno a utilisé BioDynaMo pour rechercher comment réduire ces effets secondaires. Il a pu utiliser cette technologie pour reproduire une très petite section des poumons – un segment alvéolaire – afin de voir ce qui se passerait lorsque les rayonnements interagiraient avec les tissus normaux. Cela a permis de recréer ce qui se passe chez l’être humain après le traitement, plutôt que de se concentrer sur d’autres animaux, devenant ainsi le premier modèle mécanistique à reproduire les comportements humains.
« L’idée était d’utiliser BioDynaMo pour reproduire les dommages causés aux tissus normaux, ce qui était assez nouveau. La plupart des modèles existants sont utilisés pour simuler les tumeurs, leur croissance et leur réponse aux traitements. Dans ce cas, nous voulions voir ce qui se passe au niveau des tissus sains, et BioDynaMo s’est avéré extrêmement utile. »
La technique de modélisation des tissus était nouvelle, car les chercheurs utilisent généralement des modèles estimés à partir d’années d’expérience basées sur des années de traitement de la population. Le Dr Cogno a pu prendre un patient et ajuster son modèle en fonction des caractéristiques spécifiques de ce patient, ce qui signifie que la radiothérapie pouvait être plus personnalisée.
« J’étais particulièrement heureux car c’était quelque chose de nouveau : l’utilisation de la modélisation mécanistique pour remplacer la réponse des tissus normaux aux rayonnements. »
Selon le Dr Cogno, les principaux avantages de BioDynaMo sont les suivants :
Il s’agit d’un logiciel open source qui peut être téléchargé et installé en quelques minutes.
Il est polyvalent et peut être utilisé pour simuler toutes sortes d’environnements.
Il est rapide et facile à utiliser.
BioDynaMo est une technologie innovante qui devrait être développée davantage afin d’accroître ses applications. Avec votre soutien, nous pouvons étendre les capacités du logiciel pour mener des recherches encore plus révolutionnaires.